MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE02

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017446	ATC	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785435
2	NC_017446	CGG	2	6	94	99	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
3	NC_017446	TCA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785435
4	NC_017446	TGG	2	6	164	169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785435
5	NC_017446	CAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785435
6	NC_017446	GCG	2	6	307	312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
7	NC_017446	TGA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785435
8	NC_017446	GGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785435
9	NC_017446	CTGG	2	8	405	412	0 %	25 %	50 %	25 %	385785435
10	NC_017446	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785435
11	NC_017446	A	6	6	547	552	100 %	0 %	0 %	0 %	385785435
12	NC_017446	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	385785435
13	NC_017446	GA	3	6	627	632	50 %	0 %	50 %	0 %	385785435
14	NC_017446	ACC	2	6	728	733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785435
15	NC_017446	ATCA	2	8	808	815	50 %	25 %	0 %	25 %	385785435
16	NC_017446	CAG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785435
17	NC_017446	TGC	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785435
18	NC_017446	GTA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785435
19	NC_017446	CAGA	2	8	891	898	50 %	0 %	25 %	25 %	385785435
20	NC_017446	GGC	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785435
21	NC_017446	A	6	6	948	953	100 %	0 %	0 %	0 %	385785435
22	NC_017446	CAC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017446	CAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017446	ACA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017446	TCA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017446	CAGGA	2	10	1110	1119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017446	AAG	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017446	AGAA	2	8	1299	1306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017446	TGA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017446	TTCT	2	8	1385	1392	0 %	75 %	0 %	25 %	385785436
31	NC_017446	GAC	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
32	NC_017446	AGT	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785436
33	NC_017446	CTG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
34	NC_017446	GCT	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
35	NC_017446	CAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
36	NC_017446	CTG	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
37	NC_017446	CCA	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785436
38	NC_017446	CAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
39	NC_017446	GCA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
40	NC_017446	GGC	2	6	2023	2028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785436
41	NC_017446	TTCTC	2	10	2034	2043	0 %	60 %	0 %	40 %	385785436
42	NC_017446	CTG	3	9	2116	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
43	NC_017446	C	6	6	2204	2209	0 %	0 %	0 %	100 %	385785436
44	NC_017446	ATGCTG	2	12	2223	2234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385785436
45	NC_017446	TGC	2	6	2358	2363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785436
46	NC_017446	CCG	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
47	NC_017446	GCGG	2	8	2473	2480	0 %	0 %	75 %	25 %	385785436
48	NC_017446	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
49	NC_017446	GCC	2	6	2557	2562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
50	NC_017446	T	6	6	2708	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	385785436
51	NC_017446	TCC	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785436
52	NC_017446	CAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785436
53	NC_017446	GCC	3	9	2825	2833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785436
54	NC_017446	ATC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785436
55	NC_017446	GTT	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785437
56	NC_017446	AGC	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785437
57	NC_017446	GAAG	2	8	3046	3053	50 %	0 %	50 %	0 %	385785437
58	NC_017446	CAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785437
59	NC_017446	TGC	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785437
60	NC_017446	TGC	2	6	3198	3203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785437
61	NC_017446	CGGG	2	8	3222	3229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017446	CGG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017446	CCT	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785438
64	NC_017446	GCG	2	6	3492	3497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785438
65	NC_017446	AGCGGT	2	12	3513	3524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385785438
66	NC_017446	C	6	6	3598	3603	0 %	0 %	0 %	100 %	385785438
67	NC_017446	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	385785438
68	NC_017446	GGC	2	6	3639	3644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785438
69	NC_017446	ATC	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785438
70	NC_017446	CCTGC	2	10	3713	3722	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_017446	TC	3	6	3735	3740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017446	TG	3	6	3816	3821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017446	C	6	6	3828	3833	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_017446	GCA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017446	GA	3	6	3940	3945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017446	CTGA	2	8	3973	3980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017446	ACC	2	6	4072	4077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017446	T	6	6	4089	4094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017446	A	7	7	4123	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017446	AAG	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017446	GAACC	2	10	4170	4179	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017446	CGG	2	6	4519	4524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785439
83	NC_017446	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	385785439
84	NC_017446	CGA	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785439
85	NC_017446	ATG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785439
86	NC_017446	T	6	6	4799	4804	0 %	100 %	0 %	0 %	385785439
87	NC_017446	ACGGG	2	10	4851	4860	20 %	0 %	60 %	20 %	385785439
88	NC_017446	CGG	2	6	4988	4993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785439
89	NC_017446	AGC	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785439
90	NC_017446	GGCT	2	8	5071	5078	0 %	25 %	50 %	25 %	385785440
91	NC_017446	GCG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785440
92	NC_017446	G	6	6	5133	5138	0 %	0 %	100 %	0 %	385785440
93	NC_017446	CCG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785440
94	NC_017446	GGA	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785440
95	NC_017446	GCCA	2	8	5286	5293	25 %	0 %	25 %	50 %	385785440

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.